Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms