Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
UbbP0CG49 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms