Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spta1P08032 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms