Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ccl20O89093 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ccl20O89093 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ccl20O89093 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ccl20O89093 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ccl20O89093 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ccl20O89093 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ccl20O89093 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ccl20O89093 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ccl20O89093 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ccl20O89093 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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