Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BlmO88700 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BlmO88700 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BlmO88700 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BlmO88700 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BlmO88700 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BlmO88700 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BlmO88700 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BlmO88700 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BlmO88700 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BlmO88700 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BlmO88700 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BlmO88700 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BlmO88700 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BlmO88700 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BlmO88700 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BlmO88700 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BlmO88700 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BlmO88700 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BlmO88700 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BlmO88700 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BlmO88700 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BlmO88700 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BlmO88700 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BlmO88700 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BlmO88700 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BlmO88700 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BlmO88700 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BlmO88700 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BlmO88700 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BlmO88700 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BlmO88700 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BlmO88700 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BlmO88700 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BlmO88700 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BlmO88700 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BlmO88700 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BlmO88700 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BlmO88700 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BlmO88700 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BlmO88700 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BlmO88700 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BlmO88700 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BlmO88700 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BlmO88700 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BlmO88700 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BlmO88700 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BlmO88700 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BlmO88700 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BlmO88700 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BlmO88700 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BlmO88700 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BlmO88700 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BlmO88700 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BlmO88700 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BlmO88700 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BlmO88700 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BlmO88700 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BlmO88700 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BlmO88700 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BlmO88700 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BlmO88700 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BlmO88700 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BlmO88700 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BlmO88700 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BlmO88700 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BlmO88700 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BlmO88700 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BlmO88700 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BlmO88700 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BlmO88700 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BlmO88700 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BlmO88700 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BlmO88700 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BlmO88700 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BlmO88700 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BlmO88700 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BlmO88700 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BlmO88700 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BlmO88700 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BlmO88700 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BlmO88700 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BlmO88700 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BlmO88700 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BlmO88700 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BlmO88700 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BlmO88700 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BlmO88700 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BlmO88700 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BlmO88700 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BlmO88700 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BlmO88700 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BlmO88700 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BlmO88700 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BlmO88700 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BlmO88700 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BlmO88700 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BlmO88700 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BlmO88700 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BlmO88700 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms