Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClppO88696 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ClppO88696 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClppO88696 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClppO88696 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClppO88696 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClppO88696 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClppO88696 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClppO88696 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ClppO88696 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClppO88696 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClppO88696 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClppO88696 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClppO88696 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClppO88696 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClppO88696 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClppO88696 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClppO88696 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClppO88696 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClppO88696 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClppO88696 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClppO88696 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClppO88696 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClppO88696 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClppO88696 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ClppO88696 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ClppO88696 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ClppO88696 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClppO88696 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClppO88696 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClppO88696 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClppO88696 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClppO88696 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClppO88696 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClppO88696 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClppO88696 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClppO88696 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ClppO88696 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClppO88696 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClppO88696 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClppO88696 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClppO88696 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClppO88696 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClppO88696 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClppO88696 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClppO88696 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClppO88696 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClppO88696 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClppO88696 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClppO88696 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClppO88696 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClppO88696 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClppO88696 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ClppO88696 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClppO88696 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClppO88696 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClppO88696 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClppO88696 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClppO88696 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ClppO88696 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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ClppO88696 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClppO88696 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClppO88696 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClppO88696 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClppO88696 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClppO88696 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClppO88696 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClppO88696 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClppO88696 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClppO88696 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClppO88696 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClppO88696 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClppO88696 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClppO88696 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ClppO88696 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClppO88696 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClppO88696 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClppO88696 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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ClppO88696 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClppO88696 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClppO88696 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClppO88696 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClppO88696 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClppO88696 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClppO88696 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClppO88696 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClppO88696 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClppO88696 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClppO88696 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClppO88696 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClppO88696 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClppO88696 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClppO88696 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClppO88696 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClppO88696 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClppO88696 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClppO88696 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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