Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stra6O70491 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Stra6O70491 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stra6O70491 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stra6O70491 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stra6O70491 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stra6O70491 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stra6O70491 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stra6O70491 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stra6O70491 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Stra6O70491 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stra6O70491 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms