Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcc1O35379 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcc1O35379 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcc1O35379 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcc1O35379 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcc1O35379 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcc1O35379 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcc1O35379 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcc1O35379 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcc1O35379 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcc1O35379 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcc1O35379 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcc1O35379 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcc1O35379 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcc1O35379 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcc1O35379 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcc1O35379 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcc1O35379 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Abcc1O35379 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Abcc1O35379 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Abcc1O35379 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Abcc1O35379 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Abcc1O35379 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Abcc1O35379 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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Abcc1O35379 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Abcc1O35379 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Abcc1O35379 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Abcc1O35379 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Abcc1O35379 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
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Abcc1O35379 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Abcc1O35379 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Abcc1O35379 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Abcc1O35379 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Abcc1O35379 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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Abcc1O35379 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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Abcc1O35379 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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Abcc1O35379 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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Abcc1O35379 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcc1O35379 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms