Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ArxO35085 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ArxO35085 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ArxO35085 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ArxO35085 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ArxO35085 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ArxO35085 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ArxO35085 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ArxO35085 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ArxO35085 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ArxO35085 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ArxO35085 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ArxO35085 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ArxO35085 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ArxO35085 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ArxO35085 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ArxO35085 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ArxO35085 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ArxO35085 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ArxO35085 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ArxO35085 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ArxO35085 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ArxO35085 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ArxO35085 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ArxO35085 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ArxO35085 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ArxO35085 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ArxO35085 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ArxO35085 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ArxO35085 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ArxO35085 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ArxO35085 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ArxO35085 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ArxO35085 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ArxO35085 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ArxO35085 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ArxO35085 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ArxO35085 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ArxO35085 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ArxO35085 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ArxO35085 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ArxO35085 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ArxO35085 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ArxO35085 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ArxO35085 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ArxO35085 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ArxO35085 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ArxO35085 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ArxO35085 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ArxO35085 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ArxO35085 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ArxO35085 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ArxO35085 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ArxO35085 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ArxO35085 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ArxO35085 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ArxO35085 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ArxO35085 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ArxO35085 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ArxO35085 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ArxO35085 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ArxO35085 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ArxO35085 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ArxO35085 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ArxO35085 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ArxO35085 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ArxO35085 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ArxO35085 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ArxO35085 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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