Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

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Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EllO08856 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EllO08856 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EllO08856 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EllO08856 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EllO08856 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EllO08856 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EllO08856 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EllO08856 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EllO08856 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EllO08856 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EllO08856 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EllO08856 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EllO08856 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EllO08856 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EllO08856 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EllO08856 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EllO08856 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EllO08856 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EllO08856 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EllO08856 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EllO08856 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EllO08856 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EllO08856 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EllO08856 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EllO08856 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EllO08856 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EllO08856 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EllO08856 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EllO08856 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EllO08856 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EllO08856 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EllO08856 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EllO08856 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EllO08856 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EllO08856 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
EllO08856 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EllO08856 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EllO08856 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EllO08856 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EllO08856 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EllO08856 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
EllO08856 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EllO08856 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EllO08856 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EllO08856 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EllO08856 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EllO08856 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EllO08856 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EllO08856 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
EllO08856 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
EllO08856 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EllO08856 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EllO08856 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EllO08856 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EllO08856 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EllO08856 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EllO08856 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
EllO08856 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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