Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MttpO08601 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MttpO08601 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MttpO08601 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MttpO08601 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MttpO08601 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
MttpO08601 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MttpO08601 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MttpO08601 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MttpO08601 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MttpO08601 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MttpO08601 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MttpO08601 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MttpO08601 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MttpO08601 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MttpO08601 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MttpO08601 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MttpO08601 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MttpO08601 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MttpO08601 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MttpO08601 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MttpO08601 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MttpO08601 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MttpO08601 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MttpO08601 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
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MttpO08601 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MttpO08601 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MttpO08601 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MttpO08601 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MttpO08601 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MttpO08601 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MttpO08601 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MttpO08601 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MttpO08601 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MttpO08601 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MttpO08601 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MttpO08601 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MttpO08601 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MttpO08601 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MttpO08601 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MttpO08601 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MttpO08601 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MttpO08601 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MttpO08601 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MttpO08601 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MttpO08601 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MttpO08601 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MttpO08601 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MttpO08601 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MttpO08601 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MttpO08601 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MttpO08601 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
MttpO08601 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
MttpO08601 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MttpO08601 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MttpO08601 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms