Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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