Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms