Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3278L7N2D2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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