Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vwa3bJ9JI28 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms