Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Gm2056J3QQ02 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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