Protein–RNA interactions for Protein: J3QPI0

Gm8298, Predicted gene 8298, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8298J3QPI0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm8298J3QPI0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm8298J3QPI0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm8298J3QPI0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8298J3QPI0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms