Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm5294J3QP53 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5294J3QP53 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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