Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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