Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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