Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm29394H3BIW7 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm29394H3BIW7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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