Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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