Protein–RNA interactions for Protein: G5E829

Atp2b1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, mousemouse

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Length 1,220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b1G5E829 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Atp2b1G5E829 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Atp2b1G5E829 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Atp2b1G5E829 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Atp2b1G5E829 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Atp2b1G5E829 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Atp2b1G5E829 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Atp2b1G5E829 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Atp2b1G5E829 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Atp2b1G5E829 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b1G5E829 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms