Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms