Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm8005F6YKY3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Gm8005F6YKY3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Gm8005F6YKY3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Gm8005F6YKY3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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