Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21977F6U3N7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms