Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Urb2E9Q7L1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms