Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Ccdc71lE9Q4T4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ccdc71lE9Q4T4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ccdc71lE9Q4T4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ccdc71lE9Q4T4 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ccdc71lE9Q4T4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ccdc71lE9Q4T4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccdc71lE9Q4T4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccdc71lE9Q4T4 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccdc71lE9Q4T4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccdc71lE9Q4T4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccdc71lE9Q4T4 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccdc71lE9Q4T4 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc71lE9Q4T4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc71lE9Q4T4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc71lE9Q4T4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc71lE9Q4T4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc71lE9Q4T4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc71lE9Q4T4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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