Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd2E9Q1M1 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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