Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Myo5cE9Q1F5 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms