Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sfta2E9PXB6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms