Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc8E9PWG2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms