Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms