Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc6D3YZP9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms