Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf217D3YYI7 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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