Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cttnbp2B9EJA2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms