Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syce3B5KM66 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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