Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms