Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms