Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Atp8b5A3FIN4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Atp8b5A3FIN4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Atp8b5A3FIN4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Atp8b5A3FIN4 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Atp8b5A3FIN4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Atp8b5A3FIN4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Atp8b5A3FIN4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Atp8b5A3FIN4 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Atp8b5A3FIN4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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