Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms