Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc163A2AGD7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms