Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmpd4A2AFR3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms