Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Pramef6A2A8M8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Pramef6A2A8M8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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