Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm17026-201ENSMUST00000166674 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm17124-201ENSMUST00000168320 1379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm21049-201ENSMUST00000197078 987 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm31752-201ENSMUST00000199456 856 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm44527-202ENSMUST00000204519 1314 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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