Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms