Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms