Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer1Q9Z2Y3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms