Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
RfxankQ9Z205 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
RfxankQ9Z205 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
RfxankQ9Z205 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
RfxankQ9Z205 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RfxankQ9Z205 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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