Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1S0

Bub1b, Mitotic checkpoint serine/threonine-protein kinase BUB1 beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bub1bQ9Z1S0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bub1bQ9Z1S0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms